公元7世纪成为阿拉伯帝国的一部分。阿拉伯人不断移入，并和当地土著居民同化，逐步形成了现代巴勒斯坦阿拉伯人。 此后的几千年，耶路撒冷一直是由巴勒斯坦阿拉伯人居住，直到二战期间。在这期间他们抗击十字军等侵略者，付出了大量的牺牲。

二战后，犹太人大量从其他地区迁入，同时驱逐巴勒斯坦人，改变了当地的人口成分。

耶路撒冷能够成为三教圣城的最主要原因当然是它独一无二的历史进程；而它之所以仍然被尊奉至今，而不是像历史上其他五花八门的许多“圣地”一样烟消云散或者只剩残骸，则是和近一个世纪的政治格局分不开的。这么排耶路撒冷的历史分期也许能把问题说得清楚一点 （括号内是该时期城市中最强大的宗教势力）：

一.圣殿时期 （犹太教）

对耶路撒冷的控制权，最有发言权的民族大概就是犹太人。如果按照“自古以来”的定义，正是犹太人在耶路撒冷最早期的历史上建设了这座城市。最早的犹太王国在此定都、兴建圣殿，犹太人可以说是耶路撒冷的造物主。

最开始耶路撒冷所在的地方就是一个小村庄，后来因为它在迦南地区（Cannan，也就是今天的巴勒斯坦地区）的地理优势——向西可以俯瞰从埃及到小亚细亚/美索不达米亚的地中海沿岸商路，向东可以监视该地区最重要的水源约旦河——而被当地的土著人建成一个小型要塞。

二. 耶稣传教与罗马帝国统治后期（基督教）

犹太人被罗马人赶走后，耶路撒冷这座城市就开始在不同教派的手中转移。一开始这里被罗马人改造成了伟大的基督教城市。犹太教和基督教本来就有着藕断丝连的亲缘关系，耶路撒冷成为两教圣地并不特别奇怪。

耶路撒冷及周边的统治权落到了希律王的手中，他是一个口口声声说自己是犹太人但其实比罗马人还更像罗马人的以东人（真绕。。。），并且是凯撒的好基友（还救过凯撒一命）。所以名义上犹太人还掌握着耶路撒冷，实际上罗马人想当占领军是分分钟的事。根据圣经新约（希伯来圣经当然是没有这一段的）记载，耶稣就是出生在希律王的统治时期。

犹太人觉得生活处处受制于罗马人很不爽了，不断起义，在哈德良做皇帝的时候，罗马人彻底忍不了城中犹太人没完没了的反抗，干脆把耶路撒冷整个儿铲平了，犹太人也就开始大流散。

三. 阿拉伯帝国崛起与扩张 （伊斯兰教）

耶路撒冷对穆斯林来说的重要之处，在于先知默罕默德在这里完成过一次升天的壮举。为了纪念默罕默德在圣训中提到的夜晚飞升之处，阿拉伯人建设了两座清真寺，也就是著名的圆顶清真寺和阿克萨清真寺。

不过由于当时阿拉伯帝国如日中天信心爆棚，和同时期的东土大唐一样对宗教和民族特别宽容，连犹太人都被允许常回家看看。

400年后，阿拉伯帝国光辉不在，新王朝的哈里发对民族混杂的耶路撒冷局势有点慌张，便开始迫害犹太人和基督徒。最出格的行为，就是把基督徒苦苦追寻几百年的圣墓教堂给拆了。这在宗教层面上直接导致了第一次十字军东征，欧洲基督徒和穆斯林之间持续至今的冲突开场了。

四. 十字军东征 （基督教）

十字军虽然夺回了耶路撒冷，但是驻守当地的基督教小国家各怀鬼胎，在和阿拉伯英雄萨拉丁的战斗中落败。即使狮心王出面也没有能够挽回败局，耶路撒冷又成了穆斯林城市。虽然城市所属的国家寂静起手，这个城市属于穆斯林的状态却一直没有改变。

五. 混战及之后奥斯曼帝国的统治 （伊斯兰教)

1517年，新崛起的奥斯曼帝国攻占了耶路撒冷，这个苦难的城市终于可以有喘息的机会了，奥斯曼统治下的耶路撒冷经历了缓慢的复兴，比如苏莱曼大帝就重建了圆顶清真寺和城墙。

当欧洲国家开始步入近代化社会的时候，对东方充满好奇的探险者和传教士们可以毫无限制地进出这座城市。而真正改变这座城市今后命运的，是此时在东欧愈演愈烈的反犹主义。先是信奉正统犹太教、相信弥赛亚救赎的宗教人士大量涌入耶路撒冷慢慢地改变了这座城市的人口比例，之后，随着犹太复国主义的诞生，越来越多年轻的东欧犹太人也来到了巴勒斯坦地区。在奥斯曼土耳其人的统治下，当地的阿拉伯人还能在一定程度上与新来的犹太移民保持着相对良好的关系（反正大家都是被统治阶级，再加上犹太人口占整个地区人口的比例还是相对较小）。但随后在第一次世界大战期间，英法联军几经周折终于干翻了奥斯曼帝国，成功进入耶路撒冷。

六. 现代以色列 （犹太教）

在英国的主持下，联合国于1947年表决通过了181号决议，将耶路撒冷周边东至阿布迪斯，南至伯利恒，西至艾因卡里姆，北至舒法特的地区，单独成立一个独立个体。城中居民不属于以色列，也不属于巴勒斯坦。1948年，更是把这个独立体划归联合国托管理事会代管。

由于是联合国大会表决通过的决议，且五大佬均点头同意，这个决定就带有了明确的国际约束力。在法理上，世界各国，尤其是主导这次决议的欧洲国家，都不承认耶路撒冷是以色列的城市。

20年后，借着第三次中东战争，以色列人完全收复了耶路撒冷全城。为了明确这座重点城市的国家地位，1980年以色列国会通过了著名的《耶路撒冷法》，确定了耶路撒冷的法定首都地位——当然国际社会是不承认的，非但不承认还严厉谴责以色列。

至于巴勒斯坦阿拉伯人，只能幽怨地看着以色列的倔强，顺便画画圈圈诅咒这帮外来户了……当然，他们也把法定首都设在耶路撒冷，更准确地说是约旦曾经占据过的耶路撒冷东部。

就这样，耶路撒冷成为了两个国家的首都，以及名义上的国际代管区域。在谈判桌上，这里的归属问题可能永远都纠缠不清了。